遠(yuǎn)在人類(lèi)文明15,000年前，地球上的高智能哥斯麼族就被兩只大昆蟲(chóng)型怪物—摩斯拉及巴特拉所摧毀。而在一次山崩後，現(xiàn)今日本的伊房島上卻將埋藏在地下的摩斯拉巨蛋發(fā)掘來(lái)。其後三只史上最強(qiáng)大的怪獸—哥斯拉、摩斯拉及巴特拉碰頭對(duì)決，雖然大怪獸摩斯拉及巴特拉聯(lián)手成功將哥斯拉封印在海中，但人類(lèi)的危機(jī)卻并未解決，因?yàn)橐活w超巨大的隕石將撞向地球…